鸡舍在进小鸡或者出售成品鸡之前要进行彻底的冲洗和消毒，我们大型养殖场常常要用到高压清洗机或者高压水枪，一般小型场地用自来水管直接冲洗即可，然后用火焰对笼具消毒效果更好，也就是烟熏方法。在我们农村的话一般用火来消毒，这也是最直接、最节约的笨方法了。
我们养殖场日常的消毒用具有：喷雾器、消毒池、紫外线等等都可以用作消毒的工具，防疫用具有连续注射器、玻璃注射器以及冰箱等。
在以前的农村，很多家庭养鸡都是鸡粪和那个稻草垫料随地堆放，病、死鸡随意的丢弃，甚至食用的现象都常常出现，粪便、污水、死鸡对环境的污染问题，已经很严重的影响了肉鸡生产的安全，所以加强鸡舍的预防管理，还有卫生才能使鸡顺利的成长，才能提高经济效益。
如果大规模养殖小鸡，鸡舍内都环境条件差，那么也会影响到鸡的健康和生产性能，所以必须保证每只小鸡所占的地面面积，合理组织供暖和通风，及时更换垫料（我们常用的垫料就是锯木面）保持室内的卫生才能提高小鸡生长、健康的关键。
俗话说，养殖小鸡重在预防，是靠养，靠管理而不是治。肉鸡鸡舍清理，有以下几个步骤：①清理上一批鸡出栏的粪便，人工打扫装袋子，然后堆放到地头或者出售给种植户。②用高压水枪冲洗地面，如果没有就直接用胶管冲洗干净。③让鸡舍里面通风，使地面烘干，可以用艾蒿烟熏消毒或者用生石灰粉消毒④用灯光进行消毒，消毒灯要开一个晚上进行鸡舍消毒⑤投入小鸡前必须要做好前几个步骤，之后拿锯木面当做垫料，全部垫在你所有投放鸡苗的地方即可。
作为肉鸡生产企业或者养殖户，一定要加强卫生防疫，确保安全生产，才能够减少病鸡、死鸡的出现，才能提高鸡肉的卫生质量，才能提高产品质量。所以需要加强污染防范措施，改善鸡舍的卫生也是养殖户的头等大事。
最后，小鸡鸡舍除了以上所说的方法之外，我们还可以用消毒液进行消毒，每次清理粪便以后进行1次消毒。我们在使用消毒液的过程中，用药量有讲究的，不然没效果，每平米用药应该按照药物说明书使用，如果是喷雾的话，要按照鸡舍的体积来计算用药。
正确选择消毒液，才能达到理想效果，各种类型的消毒液交换使用，才能达到对每一类病毒具有消灭作用，（氧化剂、碘、氯离子、季胺盐）这几种消毒液交换使用。
综上所叙，小鸡鸡舍有以上几种消毒、清理方法之外，还有注意鸡舍内的通风和温度。
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